东京的郊外的森林里，某个山腰上建立着一座华丽的和式庭院。
这里常年被结界封印着，普通人经过这里看到的只是一片树林。
千百年来这里一直居住着一位背后长着两只巨大黑翅膀的女子，此人正是天狗一族的公主。
多年前外出游玩的女天狗在得知自己唯一的好友万骨坊被某个忍者杀害后发誓一定要找出那个忍者替他报仇。
在第一届生死格斗大会上她暗中观察到了冠军是一位叫做霞的少女忍者，经过调查后知道了她是来自忍之里的首领。
莫非杀死万骨坊的就是她？
但转念一想又觉得不可能，这个少女看上去也就十六七岁的模样，几年前顶多就十三四岁，虽说万骨坊的武功不是很高强，但也不至于死在一个年龄这么小的小女孩手中。
她决定要去忍之里把真正杀了她好友的那个人找出来。
在调查忍之里所在地时她知道了一个叫doatec的组织绑架了忍之里的疾风，于是独自一人前往了doatec的基地。
可惜晚了一步，当她来到基地后整个基地已经成了一片废墟。
就好像经过了一场战争一样基地的所有设备均被破坏到处都是玻璃残渣，一些巨大的玻璃试管不知道是干嘛用的横七竖八的倒在了地上。
女天狗看了看确认了这里应该已经被人为摧毁了正准备转身离开的时...
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